1、消除黑臭现象：消除黑臭现象，恢复水体的基本生态环境，这个阶段主要是利用甘度枯草芽孢杆菌、光合菌、甘度复合菌种建立优势微生物。

2.降低氨氮的有机污染：主要是通过硝化细菌把水体中的硝态氮、氨态氮等转化成氮气，从而达到降低氨氮的目的。
3、降低COD指数：投加复合菌种可以降低水体COD，形成良性循环生态系统。降解水体底泥、有机物等，降低水体污染物。
4、消解底泥，改善水体；光合细菌是一种利用光为能源并以二氧化碳或小分子有机物为碳源、以硫化氢等为供氢体进行完全自养性或非产氧的一类微生物的总称。光合成菌在自然界分布极为广泛，生命力很强。

5、迅速降低黑臭河流水体中的COD、氨氮，消除底泥中的H2S、抑制有害菌以及蓝藻的产生，提高水体透明度，起到净化水质的作用；

6、生物修复技术：将优质、高效的微生物菌种注入水中，可以改良水体和底质淤泥中的微生态，并进行有机质及营养元素的良性分解和矿化，使水体中的微生物得到净化，修复水体中的微生物，形成一个良好的生态系统。